Действия игры переносят нас в альтернативный мир "Зоны отчуждения". После взрыва атомного реактора Чернобыльской АЭС. Главный герой серии сталкер по прозвищу "Меченый", попавший на территорию Кардона в "грузовике смерти", был единственным найденным выжившем. Неизвестно хорошо ли это ещё для него. Кто он и что с ним произошло, он не помнит, однако на ПДА указана четкая задача: " Убить Стрелка"

На протяжении все игры вам предстоит исследовать Зону отчуждения. Прогуляться по ее темным местам. Повоевать с бандитами и членами других группировок, а так же не стать ужином для монстров.
Но самое главное узнать что таится за стенами энергоблока и правда ли существует "Исполнитель желаний".