Коннор уже не Коннор, а Радунхагейду. Ассассином никогда не был, бегает в капюшоне из шкуры волка. На его деревню напал Вашингтон и всех перебил. Ну тут как всегда месть и стремление узнать что же такое случилось, что история поменялась (он помнил что было в прошлой частиAssassin's Creed 3). Для этого наш индеец приобретает по мере прохождения игры суперспособности, а именно: невидимость, телепортация и супер-сила. Все это от какого-то волшебного дерева и духов зверей-покровителей. Также можно вызвать волков на подмогу. Ну всех приходится спасать. Новые способности эффектно выглядят, но они лишние. Раньше и без них было хорошо. В итоге все хорошо заканчивается и история возвращается в свое русло.